生物软件-多肽分子量计算及疏水性图谱绘制

insights · 发表于 2022-10-7 14:08

本帖最后由 insights 于 2022-10-24 12:36 编辑

软件界面

更新-增加蛋白疏水性图谱绘制
第一次用python 的tkinter做的这个生物小软件（网上有很多可用的在线小软件可以用，这个是离线的；当然一般也可以粗略计算：氨基酸数 x 氨基酸平均分子量110）。

之前用PyQt5写过邮件发送小软件，对比之下，发现还是PyQt5好用，且压缩基本不影响运行速度，只不过还得再开PyQt5先写软件界面，这次偷懒直接用了Python内置的Tkinter写的界面，但软件偏大，且打包后还影响运行速度，所以就没有打包成单文件形式了。

好了，下面说下使用：
直接把氨基酸序列复制粘贴到序列框，点击运行就OK了，

是不是很简单

。

虽然功能单一，但软件不小，勿喷勿喷

。原本还想做一个绘制多肽亲水性的工具（网上也有网页版，但我找不到参考的加权计算公式，所以就暂时搁置了）

参考文献：
1. Guan, Y., Zhu, Q., Huang, D. et al. An equation to estimate the difference between theoretically predicted and SDS PAGE-displayed molecular weights for an acidic peptide. Sci Rep 5, 13370 (2015).

2. Kyte, J; Doolittle, R. F. (1982). "A simple method for displaying the hydropathic character of a protein".
Journal of Molecular Biology. 157 (1): 105–32.玩一玩，可以自取：

https://wwm.lanzoub.com/iC8rA0eh36ta
密码:9bge
含单文件版

insights · 发表于 2022-10-11 11:10

yyk81 发表于 2022-10-11 07:54
只用于计算分子量，功能少了点，现在分子生物学软件好多。不过这个轻量，哈哈

是的，最近做蛋白表达纯化和抗体制备，时不时查查多肽分子量，每次开网页挺麻烦。网页版还有绘制多肽亲水性等功能，不过看不到他们使用的加权公司，所以就没嵌入这个功能了，其它的暂时用不到懒得花时间，基本snapgene就可以解决很多需求了

hwxq43 · 发表于 2022-10-9 04:17

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dengshichuan123 · 发表于 2022-10-9 07:04

感谢分享

太子阿丹 · 发表于 2022-10-9 08:32

挺有意思的软件，谢谢楼主的无私分享！！！

lbwnba · 发表于 2022-10-9 10:12

有心了感谢分享

dfn19931208 · 发表于 2022-10-9 11:54

感谢分享好工具辛苦了谢谢你

fxd680126 · 发表于 2022-10-10 06:30

了解了解，感谢分享！

xjjlxcb123 · 发表于 2022-10-10 08:37

很高级的，谢谢分享！

yyk81 · 发表于 2022-10-11 07:54

只用于计算分子量，功能少了点，现在分子生物学软件好多。不过这个轻量，哈哈

junwang0228 · 发表于 2022-10-11 10:30

谢谢分享，学习了

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